Job profiles at Universitätsspital Basel: Bioinformatiker/-in

One of 204 job profiles at employer Universitätsspital Basel

Role and responsibilities

Aufbau und Erhaltung der bioinformatischen Dienstleistungen für Whole Genome Sequencing der Labormedizin (Pipelines zur Erstellung von Berichten), Kreative Problemlösungen für Mitarbeiterinnen und Mitarbeiter mit diversem Hintergrund, Stetige Modernisierung der technischen Plattformen und Weiterentwicklung von bioinformatischen Anwendungen in der Labormedizin, Aktive Mitwirkung bei Aus-, Fort- und Weiterbildung, Selbständiges Initiieren und Umsetzen von Projekten, Mitarbeit bei Forschungsprojekten im Bereich der Labormedizin

Team / description

Qualifications and Skills

• Abgeschlossenes Hochschulstudium (Biologie mit starkem Fokus auf Bioinformatik, Bioinformatik, Medizininformatik, Computer Science/Informatik) wünschenswert mit PhD oder entsprechende Berufserfahrung
• Erfahrung in IT/Bioinformatik Applikations-Entwicklung und OS (Windows, OSX, Debian, Ubuntu, HPC/slurm)
• Selbständigkeit sowie gute interdisziplinäre Team- und Kommunikationsfähigkeiten
• Ausgeprägte Dienstleistungsorientierung
• Vertiefte bioinformatische Kenntnisse (Bereiche Amplicon-, Whole-Genome-Sequencing, Meta Genomics, Transcriptomics, Epigenomics, Illumina, Oxford Nanopore)
• Fundierte Kenntnisse in bioinformatischen Software-Tools (samtools, piccard, unicycler, variant calling softwares, Ridom Seqsphere+, usw.) und Programmier-Sprachen/-Tools (python, R, bash, apptainer/singularity, nextflow, git)